Ο Γιάννης Μουζακίτης είναι Ακαδημαϊκός Υπότροφος στο Τμήμα Μηχανολόγων & Αεροναυπηγών Μηχανικών του Πανεπιστημίου Πατρών στο γνωστικό αντικείμενο «Καινοτομία, Ποιότητα & Περιβάλλον». Παράλληλα, είναι Μεταδιδακτορικός Ερευνητής στο Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών (Τμ. Διοίκησης Γεωργικών Επιχειρήσεων & Συστημάτων Εφοδιασμού), καθώς και  μέλος Σ.Ε.Π. στο Ελληνικό Ανοικτό Πανεπιστήμιο (Σχολή Κοινωνικών Επιστημών).

Είναι διπλωματούχος μηχανολόγος μηχανικός και κάτοχος διδακτορικού διπλώματος από το Τμήμα Μηχανολόγων & Αεροναυπηγών Μηχανικών του Πανεπιστημίου Πατρών, έχει αποκτήσει διδακτική και ερευνητική εμπειρία σε εκπαιδευτικά ιδρύματα της Ελλάδας (Πανεπιστήμιο Πατρών, Γεωπονικό Πανεπιστήμιο, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας, Ελληνικό Ανοικτό Πανεπιστήμιο, Πανεπιστήμιο Πελοποννήσου) και του εξωτερικού (Erasmus University of Rotterdam), και έχει απασχοληθεί ως επιστημονικός συνεργάτης σε εθνικά και διεθνή ερευνητικά και αναπτυξιακά προγράμματα.

Εργασίες του έχουν δημοσιευθεί σε διεθνή περιοδικά και πρακτικά διεθνών συνεδρίων, και τα επιστημονικά του ενδιαφέροντα εστιάζουν σε γνωστικές περιοχές όπως: Περιβαλλοντική Διοίκηση, Διαχείριση Αειφορίας, Κυκλική Οικονομία, Βιομηχανική Συμβίωση, Μελέτη Κοινωνικο-Τεχνικών Συστημάτων.

Λεπτομέρειες για το ερευνητικό του έργο είναι διαθέσιμες στο Google Scholar και στο Scopus.